在 2000 年，透過與其他研究團隊的合作，Agre 發表了一個 aquaporin 的高解析度3D圖像，藉這這些數據，就能按圖索驥，仔細的描繪出一個水通道是如何運作的(圖 2)。為何它只讓水通過而不讓其它的分子或離子放行？例如細胞膜是不允許質子(H+)滲漏的，這點非常重要，因為細胞就是靠著內外質子濃度的差異來維持細胞能量儲存的系統。. 水分子通過 aquaporin AQP2 。由於通道中心的正電荷，如H3O+般帶正電荷的離子會被驅逐，這可避免質子的滲漏。選擇性是這個通道的主要性質，水分子必須順著由構成通道壁的原子所形成的電場方向，鑽過一個狹窄的通道，質子(或應稱之為 oxonium 離子，H3O+)將會在中途因為其所帶的正電荷而被驅逐。
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